Иногда в ispmanager при настройке сервера забывают снять галочки «Вести учет доступов и ошибок» из за чего на сервере просто заканчивается свободное место. Его полностью занимают логи. Чтобы их очистить нужно подключиться к серверу по sftp перейти в указанную папке у удалить файлы.
usr/local/mgr5/var/logs/